查看: 7152|回复: 34

[软件使用] 【TBtools】一个方便高通量测序数据下游利用的小工具

  [复制链接]
  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


    发表于 2016.6.20 10:36:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
           在周老大的批准下,在论坛上宣传下写给课题组的 “方便生物学研究者更有效率的利用高通量测序数据的小工具”。
           简介: TBtools用来更方便的进行一些日常数据提取和分析工作,主要包括 Fasta序列提取 本地Blast界面化 Blast结果可视化 GO注释 GO富集分析 KEGG数据库备份等... 其中经常使用的功能有界面版。
           主页:http://cj-chen.github.io/tbtools/Introduction/
           环境要求: Java Run Time 1.6 以上,大部分安装了java的操作系统均可以运行,目前Win7 Win10 Mac10.9 10.11 Linux Mint Ubuntu均测试通过
           运行方式:
                1. 界面版运行,双击TBtools_vX.XXXX.jar 即可运行
                2. 命令行运行,打开命令行,输入 java -jar TBtools_vX.XXXX.jar anyString  # 如果是在服务器终端下运行,则不需要输入任何字符,默认界面版启动失败的情况下,自动转换到命令行版启动
           界面版打开方式

           主界面介绍:


    工具下载地址:http://www.omicshare.com/forum/thread-1062-1-1.html

    本帖子中包含更多资源

    您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

    x

    评分

    参与人数 3奥币 +50 贡献 +26 收起 理由
    小圆 + 10 版主V5!
    基迪奥-周煌凯 + 20 + 16 谁试谁知道!
    Eric_Young + 20 + 10 版主V587~

    查看全部评分

    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    5 天前
  • 签到天数: 685 天

    连续签到: 1 天

    [LV.9]以坛为家II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    1
    奥币
    1741
    积分
    392
    注册时间
    2016.1.9
    在线时间
    186 小时

    发表于 2016.6.21 08:43:21 | 显示全部楼层
    这个要赞一个
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    好棒
    2018.10.30 09:38
  • 签到天数: 193 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    26
    奥币
    3367
    积分
    1567
    注册时间
    2016.1.13
    在线时间
    253 小时

    突出贡献优秀版主


    发表于 2016.6.21 09:08:14 | 显示全部楼层
    必须支持!!
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    好棒
    2018.7.20 20:12
  • 签到天数: 116 天

    连续签到: 1 天

    [LV.6]常住居民II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    5
    奥币
    35
    积分
    294
    注册时间
    2016.1.6
    在线时间
    105 小时

    发表于 2016.6.21 11:05:48 | 显示全部楼层
    这个牛逼~
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    yes!
    3 小时前
  • 签到天数: 809 天

    连续签到: 15 天

    [LV.10]以坛为家III

    中华鲟

    Rank: 5Rank: 5

    主题
    7
    奥币
    2855
    积分
    964
    注册时间
    2016.4.8
    在线时间
    336 小时

    最佳新人


    发表于 2016.6.21 19:50:36 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.4.29 20:46
  • 签到天数: 3 天

    连续签到: 1 天

    [LV.2]偶尔看看I

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    384
    积分
    65
    注册时间
    2016.4.21
    在线时间
    10 小时

    发表于 2016.6.21 21:56:30 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2018.8.15 10:33
  • 签到天数: 245 天

    连续签到: 1 天

    [LV.8]以坛为家I

    中华鲟

    Rank: 5Rank: 5

    主题
    13
    奥币
    1657
    积分
    791
    注册时间
    2016.4.28
    在线时间
    134 小时

    发表于 2016.6.21 22:55:34 | 显示全部楼层
    赞一个 不多不少
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    yes!
    2019.8.19 10:37
  • 签到天数: 48 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    中华鲟

    Rank: 5Rank: 5

    主题
    3
    奥币
    788
    积分
    879
    注册时间
    2016.4.22
    在线时间
    35 小时

    发表于 2016.6.22 14:13:06 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.5.26 15:11
  • 签到天数: 8 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    8
    奥币
    581
    积分
    422
    注册时间
    2016.5.13
    在线时间
    42 小时

    最佳新人


    发表于 2016.6.22 22:03:14 | 显示全部楼层
    很棒,楼主哪个实验室的?
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


     楼主| 发表于 2016.6.22 22:19:11 | 显示全部楼层
    bwang198703 发表于 2016.6.22 22:03
    很棒,楼主哪个实验室的?

    华南农大 园艺学院的
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    yes!
    2019.8.19 10:37
  • 签到天数: 48 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    中华鲟

    Rank: 5Rank: 5

    主题
    3
    奥币
    788
    积分
    879
    注册时间
    2016.4.22
    在线时间
    35 小时

    发表于 2016.6.24 09:31:03 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.5.26 15:11
  • 签到天数: 8 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    8
    奥币
    581
    积分
    422
    注册时间
    2016.5.13
    在线时间
    42 小时

    最佳新人


    发表于 2016.6.24 09:44:41 | 显示全部楼层
    Wuii 发表于 2016.6.22 22:19
    华南农大 园艺学院的

    楼主现在是老师?还是在读?
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


     楼主| 发表于 2016.6.24 11:45:42 | 显示全部楼层
    bwang198703 发表于 2016.6.24 09:44
    楼主现在是老师?还是在读?

    硕士在读,哈哈,咋了,也是华南农大的?
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    吃饭
    2018.7.13 11:43
  • 签到天数: 42 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    1
    奥币
    662
    积分
    279
    注册时间
    2015.12.29
    在线时间
    20 小时

    发表于 2016.6.24 14:23:36 | 显示全部楼层
    有人会用了吗
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    吃饭
    2018.7.13 11:43
  • 签到天数: 42 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    1
    奥币
    662
    积分
    279
    注册时间
    2015.12.29
    在线时间
    20 小时

    发表于 2016.6.24 14:28:20 | 显示全部楼层
    Wuii 发表于 2016.6.22 22:19
    华南农大 园艺学院的

    你们实验室自己研发的呀!厉害!
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


     楼主| 发表于 2016.6.24 15:05:41 | 显示全部楼层

    昨天已经上传用户手册了,请看另外的帖子
    http://www.omicshare.com/forum/thread-1046-1-1.html
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


     楼主| 发表于 2016.6.24 15:05:56 | 显示全部楼层
    chenSH 发表于 2016.6.24 14:28
    你们实验室自己研发的呀!厉害!

    不是研发,只是写下代码
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.5.26 15:11
  • 签到天数: 8 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    8
    奥币
    581
    积分
    422
    注册时间
    2016.5.13
    在线时间
    42 小时

    最佳新人


    发表于 2016.6.25 00:02:51 | 显示全部楼层
    Wuii 发表于 2016.6.24 11:45
    硕士在读,哈哈,咋了,也是华南农大的?

    强悍!硕士在读,就能开发这么牛的工具了。我不是你们学校的,恩,好吧,本来以为您是老师或是博士快毕业了,想请你考虑下来我们组交流或者干脆工作来着。既然您还是硕士在读,那我们只好耐心等待您毕业了。
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    忙~
    2018.5.15 08:35
  • 签到天数: 150 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    版主

    Rank: 10Rank: 10Rank: 10

    主题
    15
    奥币
    4847
    积分
    2776
    注册时间
    2016.4.20
    在线时间
    390 小时

    突出贡献优秀版主论坛元老


     楼主| 发表于 2016.6.25 06:22:52 | 显示全部楼层
    bwang198703 发表于 2016.6.25 00:02
    强悍!硕士在读,就能开发这么牛的工具了。我不是你们学校的,恩,好吧,本来以为您是老师或是博士快毕业 ...

    感谢认可。
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2018.2.9 08:18
  • 签到天数: 279 天

    连续签到: 1 天

    [LV.8]以坛为家I

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    11
    奥币
    360
    积分
    432
    注册时间
    2016.4.7
    在线时间
    144 小时

    发表于 2016.6.26 08:51:02 | 显示全部楼层
    强悍,,,学习lng
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

    您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

    本版积分规则

    快速回复 返回顶部 返回列表