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分享20个实用的科研工具

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迅猛龙

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发表于 2021.1.7 09:30:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 基迪奥-Jt桃 于 2021.1.7 09:30 编辑

不知不觉,不平凡的2020已经悄然过去。

在这一年里,基迪奥生物的微信公众号共推送了453篇图文,其中包含了大量非常实用的工具教程。好东西不能就这样悄然成为过去,我这里整理了20篇非常受欢迎的工具教程,分享给大家。

1.基因ID转换


工具名称:BioMart

工具链接:
http://www.ensembl.org/index.html

相关教程链接:
《推荐一款好用的基因ID转换工具(二)》
《推荐一款好用的基因ID转换工具》

2.序列可视化


工具名称:GeneDoc

工具链接:
https://www.omicshare.com/forum/thread-6297-1-1.html

相关教程链接:

《推荐一款“性冷淡风”的序列展示工具》

3.富集分析圈图绘制


工具名称:动态富集圈图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/ ... _enrich_circle.html

教程链接:

《你会画这种富集圈图吗?》

4.组合热图


工具名称:动态热图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportheatmap.html

教程链接:

《彩!这般漂亮又个性的热图怎么画?》

5.标星热图的绘制


工具名称:动态相关性热图(组间)

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reporticabg.html


教程链接:
《你会为热图添加“小星星”吗?》

6.对称序列LOGO图的绘制


工具名称:ggseqlogo

工具链接:
https://omarwagih.github.io/ggseqlogo/

相关教程链接:
《“师兄,这种对称的序列LOGO图怎么画?”》

7.基因集富集分析


工具名称:GSEA动态工具

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_gsea.html

相关教程链接:
《高端的GSEA往往只需采用最简单的分析工具》

8.ES折线图绘制


工具名称:Origin、ggplot2

工具链接:

https://www.omicshare.com/forum/thread-6759-1-1.html

教程链接:

《36分文章的折线图该怎么画?》

9.KEGG网络图绘制


工具名称:kegg高级网络图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/ ... senior_network.html

相关教程链接:

《基迪奥首创KEGG富集网络图工具上线》

10.个性化网络图绘制


工具名称:Gephi

工具链接:
https://www.omicshare.com/forum/thread-6116-1-1.html

相关教程链接:

《师兄,这种好看的“朱缨花”网络图怎么绘制?》

11.趋势分析


工具名称:动态趋势分析

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reporttrend.html

教程链接:
《师兄,师兄,趋势分析怎么做?》

12.差异分析雷达图的绘制


工具名称:动态雷达图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportradar.html

教程链接:
《转录组图形专题之差异基因相关图形介绍》

13.配色工具推荐


工具名称:colorfavs等

工具链接:
http://www.colorfavs.com/

相关教程链接:
《作图颜色调得好,高分文章跑不了!》

14.文章示意图绘制


工具名称:Ai

工具链接:

https://www.adobe.com/cn/

相关教程链接:

《如何绘制这般好看的示意图?》

15.主成分分析


工具名称:动态PCA

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportpca.html

教程链接:

《点点鼠标可轻松完成PCA、CCA、RDA、NMDS、PCoA、t-SNE分析?》

16.富集分析气泡图绘制


工具名称:动态富集差异气泡图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/ ... ch_diff_bubble.html

教程链接:
《喏,最新的富集分析组合气泡图画法拿去~》

17.显微图像处理


工具名称:ImageJ

工具链接:
https://www.omicshare.com/forum/thread-2783-1-1.html

相关教程链接:
《如何自由调整显微照片的标尺?》

18.花瓣韦恩图的绘制


工具名称:动态维恩图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportvenn.html

教程链接:
《师妹,请留步!我教你画花瓣韦恩图》

19.圈图的绘制


工具名称:动态circos图

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportcircos.html

教程链接:
《“没有人比我更懂如何绘制好看的圈图...”》

20.小提琴图的绘制


工具名称:
动态小提琴(分组)

工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportviolin2.html

教程链接:
《无需编程轻松绘制“上流”的小提琴图》


我欣喜得发现,在这20篇比较受欢迎的工具教程中,有12个工具是来自OmicShare!OmicShare已经5周年啦,目前上线了126个小工具(还有很多工具在开发中),引用文章近1000篇,欢迎大家前去使用!

“最美的风景在下一程”,2021年,我们仍将热泪盈眶,奋勇向前!

OmicShare网址:
https://www.omicshare.com/

本文作者:基迪奥-莫北              


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今天也是元气满满的一天啊!
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mark一下
开了一上午的组会
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