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[ChIP-seq] chipseq可视化,UCSC上传文件问题求助

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钵水母

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发表于 2016.12.30 12:25:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
各路大神,大家好。 最近在折腾chipseq的可视化, IGV由于出来的图分辨率太不清晰, 所以本人打算放弃了,这两天在研究UCSC,但是老传不上去, 问题如下,希望大家能帮忙解答:
1 上传wig文件, 文件形式如下:
variableStep chrom=chr10
88988531 0.116840785239013
88988532 0.116840785239013
88988533 0.116840785239013
88988534 0.116840785239013
88988535 0.116840785239013
上传的时候在如下界面,选择文件之后submet出来的问题如图所示:


我现在手里是wig文件,请问怎么样才能传上去呢?急用。
谢谢大家!

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钵水母

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 楼主| 发表于 2016.12.30 14:11:13 | 显示全部楼层
找到解决办法了,哈哈 原来加一个表头就可以咯!
track type=wiggle_0 name="wt" description="variableStep format" visibility=full autoScale=off viewLimits=0.0:25.0
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钵水母

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 楼主| 发表于 2016.12.30 14:37:56 | 显示全部楼层
额,现在的问题是如何调整,refseq基因的颜色, 如何去掉track上的阴影? 请问有人知道不?
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帝王蝶

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发表于 2017.1.1 10:26:17 | 显示全部楼层
默默帮顶
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钵水母

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发表于 2017.5.4 13:16:56 | 显示全部楼层
面板配制都可以调整的
****
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钵水母

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发表于 2021.6.1 01:34:33 | 显示全部楼层
你好,你知道怎么chipseeker传参数将gene iD 变为Gene name吗?我传了参数但是结果还是未变化,
限制最少3个
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帝王蝶

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发表于 2021.6.3 15:31:18 | 显示全部楼层
gabengdou 发表于 2016.12.30 06:11
找到解决办法了,哈哈 原来加一个表头就可以咯!
track type=wiggle_0 name="wt" description="variableSte ...

加油!
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