CDS转蛋白

发布时间:
2015-10-09 15:14:22
作者:
admin
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把CDS fasta序列转换成蛋白序列
输入或者上传fasta格式的CDS序列

选择密码子表,目前只能选择1号或11号密码子表。

程序将输出fasta格式的蛋白序列结果

示例文件(可右击下载:)源文件

输入DNA序列(CDS蛋白编码序列),选择密码子表1
>NF53_0002
ATGCGTTTTACAATACAAAAAGACTATCTTGTAAGAGGTGTACAAGATGTAATGAAGGCA
GTTTCTTCTCGTACAACAATCCCCATCCTTACGGGAATTAAAGTTGTAGCTACTGAAGAA
GGGGTTACATTAACAGGAAGCGATGCTGATATTTCTATTGAATCGTTTATTCCAGTCGAA
GAAGATGGAAAAGAAATCGTAGAAATTGCTCAATCAGGAAGCATTGTTTTACAGGCAAAA
TATTTTAGTGAGATTGTAAAAAAACTACCTAAAGACACTGTCGAAATTTCTGTAGAAAAT
CATTTTATGACAAAAATAAAATCTGGAAAATCAGAGTTTAACTTAAATGGTTTAGATTCT
GCAGAATATCCGTTATTGCCACAGATTGAAGAACATCATGTATTTAAGATACCAACAGAT
TTACTTAAGCATATGATCAGACAAACTGTATTTGCAGTTTCTACTTCTGAAACAAGACCG
ATCTTGACAGGTGTAAACTGGAAGGTATATAACAGCGAGTTAACTTGTATTGCAACAGAT
AGTCATAGACTGGCACTTCGAAAAGCAAAAATTGAAGGACATAACATTGCAGATGAATTC
CAAGCTAATGTTGTTATTCCAGGTAAGAGCTTAAATGAATTAAGTAAAATTTTAGATGAG
TCTGAAGAAATGGTAGATATCGTTATTACGGAGTATCAAGTATTATTCCGTACAAAACAT
TTATTATTCTTCTCAAGATTGTTAGAAGGAAATTATCCTGATACGACACGTTTAATTCCA
GCAGAGAGTAAAACGGATATTTTTGTAAATACAAAAGAATTCCTACAAGCAATTGATCGT
GCTTCACTATTAGCAAGAGATGGCCGCAATAACGTTGTTAAATTATCAACTTTAGAGCAA
GAAATGCTAGAGATTTCTTCGAATTCACCAGAAATCGGAAAAGTTGTCGAAGAAGTACAA
TGCGAAAAAGTAGATGGAGAAGAGTTAAAAATATCTTTTAGTGCAAAATATATGATGGAT
GCATTAAAAGCTTTGGATAGTACAGAGATTAAAGTTAGCTTTACTGGGGCAATGAGACCG
TTCTTAATTCGTACAGTAAATGATGATTCAATTATTCAATTAATTTTACCGGTTCGTACT
TACTAG
    
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输出蛋白序列结果为:
>NF53_0002
MRFTIQKDYLVRGVQDVMKAVSSRTTIPILTGIKVVATEEGVTLTGSDADISIESFIPVE
EDGKEIVEIAQSGSIVLQAKYFSEIVKKLPKDTVEISVENHFMTKIKSGKSEFNLNGLDS
AEYPLLPQIEEHHVFKIPTDLLKHMIRQTVFAVSTSETRPILTGVNWKVYNSELTCIATD
SHRLALRKAKIEGHNIADEFQANVVIPGKSLNELSKILDESEEMVDIVITEYQVLFRTKH
LLFFSRLLEGNYPDTTRLIPAESKTDIFVNTKEFLQAIDRASLLARDGRNNVVKLSTLEQ
EMLEISSNSPEIGKVVEEVQCEKVDGEELKISFSAKYMMDALKALDSTEIKVSFTGAMRP
FLIRTVNDDSIIQLILPVRTY