火山图





选择文件 格式示例











差异倍数的变化阈值




P值或Q值的阈值


(选填,x轴最大值)


(选填,y轴最大值)



nodiff的颜色

up的颜色

down的颜色

  任务完成后发邮件通知我

 使用一次消耗奥币数 1



功能:
以组间差异倍数取以2为底的对数(log2(FC))为横坐标,以差异显著性检验p-value(q-value)取10为底的对数的负值(-log10(p))为纵坐标,给差异显著(一般为差异倍数为2倍以上,且p值小于0.05)的点赋不同的颜色,来显示两组样品间的差异显著性。


输入:

①输入的表格文件,必须为txt格式。可以选择在excel中将数据打开,然后另存为"文本文件(制表符分隔)(*.txt)"。

②自定义标题,x轴、y轴标题可自行定义,默认标题(Volcano Plot),x轴标题(log2(FC)),y轴标题(-log10(p-value))。


参数:

①x轴所在的列:log2(FC)所在的列。y轴所在的列:p-value所在的列或q-value所在的列

②x轴阈值:即是差异倍数的阈值,一般为 2 或 1.5,可以自行输入。

③y轴阈值:p-value或q-value的阈值,0.01 或 0.05。

④xmax:画出的图中x轴最大值。ymax:画出的图中y轴最大的值。


输出:
输出一个火山图

示例文件:火山图例子文件  
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输出结果:

在任务界面,点击下载文件即可下载结果,包含png和pdf格式的文件和log运行信息文件。

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