高级PCA图





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可选输入:


2:手动输入列的ID:(二选一)



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3:手动输入行的ID:(二选一)



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  任务完成后发邮件通知我

 使用一次消耗奥币数 3



功能:
将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量,用3D形式展示出来。


输入:

矩阵文件:文件为二维矩阵文件,第一行一般为样本,第一列为基因名
列的ID:筛选用来做聚类分析的列,一般为样本名。如果不填即默认用上传矩阵文件中的全部列做聚类分析。列表中的每一行表示一个列名,且列名必须在矩阵文件中存在。列文件也可以包含分组信息,格式为第一列为样本名,第二列为样本所在的实验组名称。
行的ID:筛选用来做聚类分析的行,一般为基因名。如果不填即默认用上传矩阵文件中的全部行做聚类分析。列表中的每一行表示一个行名,且行名必须在矩阵文件中存在.


参数:

归一化:我们利用z-score进行数据的归一化,即将每个基因的表达量减去这个基因在所有样本中表达量的均值,然后除以其标准差。对数据进行归一化,可消除表达量异常高的基因的影响,减少数据间的“贫富差距”。我们推荐对数据进行归一化。


输出:
程序将输出主成分分析结果图,结果文件里包含两种图,一个是点上面有样本名的,一种是点上面没有样本名的。包含png格式和pdf格式。可以下载结果文件夹自行查看。

选择矩阵文件:示例文件
选择分析用到的列文件:示例文件
选择分析用到的行文件:示例文件
输入需要分析的样本和指标
生物云平台

输出结果:

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