PathWay富集分析 点击收藏

Pathway显著性富集分析以KEGG Pathway为单位,应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著性富集的Pathway

输入的文件必须为txt格式,可以在excel中将数据打开,然后另存为"文本文件(制表符分隔)(*.txt)",背景基因表文件格式为第一列是基因名称,第二列为相应的类型信息,差异表达倍数表格式第一列为基因ID,第二列为差异表达倍数。详细介绍请点击案例演示。


即想要研究的基因列表,每行第一列为基因id,要包含在背景基因表中.


选择文件 格式示例
即所有基因的列表,第一列为基因id,第二列为用于获取pathway的一个id,有3种类型kegid、ncbi-geneid、KO号(具体可以点击案例演示查看)


3:
* 注意此类型选择要与上一项基因表对应

4:
*

添加基因差异表达差异倍数  

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