序列格式化






选择文件


每行的碱基或者氨基酸的数量 *

其他参数: 序列用小写字母表示  去掉描述信息  获取反向互补序列


  任务完成后发邮件通知我

 使用一次消耗奥币数 1



功能:
将输入的fasta序列,按照自定的格式输出


输入:
要求输入或者上传的数据是fasta序列格式


参数:

①每行的碱基或者氨基酸的数量:即要求输出的内容每行的碱基数目或氨基酸数目

②序列用小写表示:默认输出的序列为小写字母,若不勾选将以大写字母格式输出

③去掉描述信息:去掉输出序列头部的描述信息

④获取反向序列:即输出为反向序列


输出:

程序将按照要求输出fasta个数的序列文档

示例文件(可右击下载):序列格式化源文件

输入的序列为:

>CYP2D6 cytochrome P450, family 2, subfamily D, polypeptide 6
MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGVF
LARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKSLEQWVTEEAACLCAAFANHSGRPFRPNGLLDK
AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLRIVVA
DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
FAFLVSPSPYELCAVPR
    
生物云平台
输出的结果为:
>CYP2D6
mglealvplavivaiflllvdlmhrrqrwaaryppgplplpglgnllhvdfqntpycfdqlrrrfgdvfslqlawtpvvv
lnglaavrealvthgedtadrppvpitqilgfgprsqgvflarygpawreqrrfsvstlrnlglgkksleqwvteeaacl
caafanhsgrpfrpnglldkavsnviasltcgrrfeyddprflrlldlaqeglkeesgflrevlnavpvllhipalagkv
lrfqkafltqldelltehrmtwdpaqpprdlteaflaemekakgnpessfndenlrivvadlfsagmvttsttlawglll
milhpdvqrrvqqeiddvigqvrrpemgdqahmpyttavihevqrfgdivplgvthmtsrdievqgfripkgttlitnls
svlkdeavwekpfrfhpehfldaqghfvkpeaflpfsagrraclgeplarmelflfftsllqhfsfsvptgqprpshhgv
faflvspspyelcavpr