COG/KOG图





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功能:

根据基因的COG/KOG ID或COG/KOG code绘制柱状统计图

“COG/KOG”是 Cluster of Orthologous Groups of proteins(蛋白相邻类的聚簇)的缩写。构成每个 COG/KOG 的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白,并且因此或者是 orthologs 或者是 paralogs.

Orthologs 是指来自于不同物种的由垂直家系(物种形成)进化而来的蛋白,并且典型的保留与原始蛋白有相同的功能.

Paralogs是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白,可能会进化出新的与原来有关的功能.


输入:

①输入的表格文件,必须为txt格式。可以选择在excel中将数据打开,然后另存为"文本文件(制表符分隔)(*.txt)"。格式有三种,缩略图如下

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参数:

①文件前缀:即最后的结果文件的前缀,可自行定义。

②类型:KOG/COG.

③输入文件类型:code/id/genecode.

④文件是否包含表头:含有表头选择是,不含有表头则选择否。


输出:
COG/KOG图 : 有png格式和pdf格式两种结果。

示例文件:示例文件1  

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输出结果:

图1: 生物云平台