案例一

发布时间:
2015-10-30 10:14:22
作者:
admin

有两组差异基因表达数据(10_centigrade和25_centigrade),需要画维恩图,并得到交集基因的表达量、功能注释等在基因总表里呈现的所有信息。
运作过程是,先利用venn图工具获取两组差异表达基因的交集基因名称,然后再使用表格筛选工具获取得到的交集基因的表达量、功能注释等在基因总表里呈现的所有信息。
①源文件: 文件一     文件二
②文件说明: 文件一是两组差异基因表达数据,使用venn图软件时的输入文件,可以得到的结果是两组差异基因的交集基因的基因名称。
文件二是基因总表,使用表格筛选软件时的输入文件。可以得到交集基因在总表的所有信息。
③使用工具: venn图     表格筛选
1.绘制维恩图,得到两组差异基因的交集

1)按照格式要求整理好数据,提交任务

生物云平台

2).查看和下载分析结果

到“我的任务”查看维恩图分析结果。点击维恩图中的交集部分,会得到相应交集基因信息。然后将交集的基因ID复制,进行下一步的表格筛选。

生物云平台
2.从基因表达总表中提取交集基因的表达量等信息

将上面复制的交集基因ID粘贴到“表格筛选”工具里的“要提取的名称清单”数据框内,或者保存为txt文件,再上传。然后上传所有基因表达量总表,根据是否有表头进行选择,并选择对第一列进行筛选。

生物云平台
3.提交任务,查看数据
生物云平台

本文版权所有归基迪奥生物科技有限公司所有