查看: 75|回复: 5

是时候展示真正好用的工具了!

[复制链接]
  • TA的每日心情

    前天 14:14
  • 签到天数: 74 天

    连续签到: 1 天

    [LV.6]常住居民II

    管理员

    Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15

    主题
    164
    奥币
    329
    积分
    2590
    注册时间
    2018.4.19
    在线时间
    482 小时

    推广达人宣传达人


    发表于 7 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
      在刚刚过去的2018年,基迪奥生物公众号为大家介绍了很多的数据分析作图的教程,有简单也有复杂的。那么有没有一个工具即使是生信小白也可以轻松进行个性化分析作图?当然有。

    没错它就是OmicShare tools。自2016年4月上线以来,目前已有170多篇文章引用。



    OmicShare在2018年又新增了12个新工具,并对已有的工具进行了优化,目前有60个工具供大家使用。那么,下面的这些新增的工具你有没有用过呢?

    1“花瓣”韦恩图
    OmicShare韦恩图工具的隐藏彩蛋:当你的数据超过5列之后,OmicShare会默认绘制“花瓣”韦恩图!


    2CCA/RDA分析

    即使没有R语言基础,广大微生物研究者用OmicShare也可做环境因子分析,只需按照范例准备数据,坐等收图即可。


    3小提琴图

    箱线图与核密度图的结合体,可用来展示gene表达丰度、微生物种群丰度、也可以是体重、长度及肿瘤大小等指标。


    4分组小提琴图

    能对两组及以上的数据表进行作图,直观比较组间数据的分布概率密度差异。


    5组内/组间相关性分析

    其实是两个独立的工具,下图是组内相关性分析得到的相关性热图示例。



    6九象限图

    多组学的关联分析的展示利器,比如下图这种转录组+蛋白组的关联分析。


    7T检验工具

    可能是OmicShare上最火的统计分析工具,虽然简单,但却实用!


    8动态GO富集分析

    之前的工具都是“静态的”,提交数据,坐等结果。动态GO富集分析工具是OmicShare推出的首个“动态”工具,可以选数据,调细节。



    9动态KEGG富集分析
    动态GO富集分析工具的同胞兄弟,同样强大,同样好用。


    10动态PCoA分析

    绘制一张理想的PCoA图,需要调整很多参数,比如物种分类水平、距离模型……只有进行更多类型的尝试和对比,才可以获得最能揭示生物学问题的PCoA图,这里推荐OmicShare的动态PCoA分析工具。



    11circos物种关系图

    你的文章中至少得有个炫酷的图吧?没事,交给OmicShare的circos图工具吧。



    12UpSet韦恩图

    UpSet韦恩图和常见的韦恩图不太一样,主要是利用连线的形式结合柱形图,来展示不同分组形式的共有和特有元素信息,对于分组较多(5组以上)的情况特别适用。



    以上就是2018年新增的12个工具,接下来我们还会推出更多好用的工具,敬请期待。
    还没用过同学可通过下面网址登陆OmicShare,嗯,赶快去尝试吧~
    网址:www.omicshare.com/tools/

                   



    本帖子中包含更多资源

    您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

    x
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    害羞
    2018.11.29 15:44
  • 签到天数: 2 天

    连续签到: 1 天

    [LV.1]初来乍到

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    32
    积分
    58
    注册时间
    2018.5.15
    在线时间
    23 小时

    发表于 7 天前 | 显示全部楼层
    厉害啦
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    害羞
    11 小时前
  • 签到天数: 427 天

    连续签到: 34 天

    [LV.9]以坛为家II

    迅猛龙

    Rank: 8Rank: 8

    主题
    24
    奥币
    2689
    积分
    1255
    注册时间
    2016.1.8
    在线时间
    277 小时

    发表于 7 天前 | 显示全部楼层
    炫酷 牛
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    吃饭
    昨天 23:56
  • 签到天数: 964 天

    连续签到: 4 天

    [LV.10]以坛为家III

    迅猛龙

    Rank: 8Rank: 8

    主题
    0
    奥币
    12395
    积分
    1051
    注册时间
    2016.5.6
    在线时间
    272 小时

    发表于 7 天前 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    前天 12:51
  • 签到天数: 386 天

    连续签到: 5 天

    [LV.9]以坛为家II

    实习版主

    Rank: 7Rank: 7Rank: 7

    主题
    51
    奥币
    3540
    积分
    1904
    注册时间
    2016.1.6
    在线时间
    205 小时

    活跃会员


    发表于 4 天前 | 显示全部楼层
    这个厉害了
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    4 天前
  • 签到天数: 12 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    25
    奥币
    1206
    积分
    407
    注册时间
    2018.7.19
    在线时间
    33 小时

    发表于 4 天前 | 显示全部楼层
    厉害了,酷炫
    回复 支持 反对

    使用道具 举报

    您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

    本版积分规则

    快速回复 返回顶部 返回列表