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[Bisulfite] 求推荐BS-seq分析软件

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帝王蝶

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发表于 2016.4.11 16:44:08 | 显示全部楼层 |阅读模式

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第一次做甲基化分析,想寻找一个比较靠谱的全基因组甲基化分析软件,哪位大神能推荐一下
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帝王蝶

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 楼主| 发表于 2016.4.11 16:45:31 | 显示全部楼层
我处理的物种是拟南芥
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活跃会员论坛元老


发表于 2016.4.12 09:23:25 | 显示全部楼层
你可以去这个网站找找:

【2014】Database,OMICtools,一个生物信息软件的分类网站
http://www.omicshare.com/forum/f ... =279&fromuid=12
(出处: OmicShare Forum)
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帝王蝶

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 楼主| 发表于 2016.4.12 14:54:13 | 显示全部楼层
基迪奥-周煌凯 发表于 2016.4.12 09:23
你可以去这个网站找找:

【2014】Database,OMICtools,一个生物信息软件的分类网站

谢谢大神
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活跃会员论坛元老


发表于 2016.4.12 22:57:10 | 显示全部楼层

比对软件 比较主流的是: Bismap 或 Bismark,各有特点,建议你两个都试试。

差异甲基化分析,可以参考附件文献。

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