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OmicShare 2017 大盘点

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    发表于 2018.1.8 12:49:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
                                                                                                       

    不知不觉,我们已然步入崭新的2018,OmicShare与我们相伴已两年多,让我们一起回顾下OmicShare在2017年的变化吧。

    云平台

    12月27日,OmicShare抓住2017年的尾巴,推出了ROC作图工具,至此,OmicShare已经有47个在线工具供用户免费使用。 2017年,用户使用OmicShare tools总计59253次,其中热图工具最受欢迎,使用了16982次,GO和PathWay富集分析12702次。 OmicShare tools 可导出发表级别的图片,据我们所了解,在2017这一年,已有 44 篇SCI文章引用OmicShare云平台。 其中,影响因子最高的一篇发表在PLOS BIOLOGY(IF=9.797)上,作者来自中国科学院海洋研究所(青岛)。发表这些文章的杂志主要有eLife(IF=7.725)、Journalof Experimental Botany (IF=5.830)、Oncotarget(IF=5.168)、Cellular Physiology and Biochemistry(IF=5.104)等等23种期刊杂志。 这些文章中OmicSharetools出现次数最高的工具是热图、GO和KEGG富集分析以及韦恩图,见下图。


    图1 部分OmicShare tools在SCI文章中出现频率的树状图

    从通讯作者所属地区来看,2017年底,已从8月底首次统计时的10 个省(直辖市)增长到 20 个(国内),见图2。



    图2 引用OmicShare 文章作者的地理分布(国内)

    在线报告

    2017年12月13日,Omicsmart在线分析报告系统上线。 Omicsmart目前主要包含两大版块:转录组数据分析和微生物多样性分析。用户可以根据不同研究目的,选择合适分组或目标基因进行分析;用户也可以自由选择不同的过滤参数,筛选目标差异基因,并且进行精美的个性化展示,如下图。



    图3 在线报告的动态调整展示(局部)

    在线课堂

    12月28日,第46期在线课堂《基于高通量测序的全方位中草药研究策略》推出,这是2017年的最后一次在线交流。在线课堂自今年5月份正式回归以来,2017年共推出了16期在线交流,累计报名人数近2500名,最高的一期达到303名。 为了更方便大家观看视频回放,在线课堂手机版网站于11月29日上线,大家可以通过基迪奥公众号底端菜单栏【在线课堂】进入观看。我们发现,大家对R语言学习热情较高,近2000名用户观看了周老师的《ggplot2绘图入门——基础图形篇》。



    图4 在移动端观看在线课堂的视频

    论     坛

    2017年,OmicShare论坛的用户数达到22061名。论坛中最活跃的板块是编程与软件(如下图),是学习生信分析的好地方。



    图5 论坛不同版块的总帖数

    在处于移动互联网时代的今天,相比于公众号、QQ群,在论坛里,好东西是会积淀下来的。目前,已有部分主题(R语言学习、重测序、群体进化)相关的帖子已整理汇总到一个帖子,希望能方便大家翻阅学习(如参见之前的篇文章《R语言教程合集分享》)。

    此外,OmicShare论坛 2.0已上线啦,全新的界面风格,全新的使用体验,欢迎大家前去体验,链接:http://www.omicshare.com/forum/



    图6 OmicShare论坛 2.0 首页截图

    今天就回顾到这里啦~
       








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