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蛋白数据库汇总【Protein Sequence&Protein Structure&Protein Domains 】

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  • TA的每日心情

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    发表于 2016.12.21 20:33:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    本帖最后由 hld8124 于 2016.12.21 21:31 编辑

    Protein Databases
    Protein Sequence Databases - Protein Structure Databases - Protein Domains, Motifs and Signatures - Others
    Protein Sequence Databases:
    Antibodies: Sequence and Structure
    BRENDA: Enzyme database
    CD Antigens:  Database of CD antigens
    dbCFC:  Cytokine family database
    Histons:  Histone sequence database
    HPRD:  Human protein reference database
    InterPro: Intergrated documentation 5resources for protein families
    iProClass: An integrated protein classification database
    KIND:  A non-redundant protein sequence database
    MHCPEP:  Database of MHC binding peptides
    MIPS:  Munich information centre for protein sequences
    PIR:  Annotated, and non-redundant protein sequence database
    PIR-ALN: Curated database of protein sequence alignments
    PIR-NREF: PIR nonredundent reference protein database
    PMD:  Protein mutant database
    PRF: Protein research foundation, Japan
    ProClass: Non-redundant protein database
    ProtoMap:  Hierarchical classification of swissprot proteins
    REBASE:  Restriction enzyme database
    RefSeq:   Reference sequence database at NCBI
    SwissProt:  Curated protein sequence database
    SPTR: Comprehensive protein sequence database
    Transfac:  Transcription factor database
    TrEMBL:  Annotated translations of EMBL nucleotide sequences
    Tumor gene database:  Genes with cancer-causing mutations
    [url=http://bmerc-www.bu.edu/wdrepeat/]WD repeats:[/url]  WD-repeat family of proteins
    Protein Structure Databases:
    Cath:  Protein structure classification
    HIV Protease:  HIV protease database 3D structure
    PDB:  3-D macromolecular structure data
    PSI: Protein structure initiative
    S2F: Structure to function project
    Scop:  Structural Classification of Proteins

    Protein Domains, Motifs & Signatures:
    BLOCKS:  Multipe aligned segments of conserved protein regions
    CCD:  Conserved domain database and search service
    DOMO:  Homologous protein domain families
    Pfam:  Database of protein domains and HMMs
    ProDom:  Protein domain database
    Prints:  Protein motif fingerprint database
    Prosite:   Database of protein families and domains
    SMART:  Simple modular architecture research tool
    TIGRFAM: Protein families based on HMMs

    Others:
    Phospho Site:  Database of phosphorylation sites

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    基迪奥小师妹 + 10 + 10 太给力了!还有链接!
    hld8124 + 20 + 10 Good job! 比较好的汇总,多谢分享,值得收.

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    好东西!马克!
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  • TA的每日心情

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    发表于 2016.12.26 12:44:48 | 显示全部楼层
    谢谢楼主
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    发表于 2016.12.27 13:18:25 | 显示全部楼层
    真全啊!
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    发表于 2016.12.27 16:40:25 | 显示全部楼层
    总结的全面
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  • TA的每日心情

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    发表于 2016.12.27 21:34:52 | 显示全部楼层
    谢谢楼主 太给力了
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  • TA的每日心情

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    謝謝分享
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