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第11期在线交流“谈谈RNA-seq和GWAS中的pvalue和Qvalue”【视频】

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发表于 2016.1.26 10:09:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
第11期在线交流“谈谈RNA-seq和GWAS中的p value 和 Q value”


二代测序数据是典型的大数据,统计是数据分析的基础。不同情况的P value估算是最常见的分析,例如:差异表达分析下的p value,gwas下的p value。由于检验次数的增加,多重检验校正又成为数据分析的必要步骤,于是Q value,adjusted p value,FDR等这些名词又冒了出来。有时候,大家都觉得晕啊!也许你可能遇到过这样的问题:




“Q value 为什么大于 p value呢”
“FDR 怎么大于1,是否分析出错了?”
“我的kegg 富集分析,FDR < 5%找不到关注的pathway,是否可以放宽阈值呢?”
“审稿人说,我的结果使用p value判断是不对的,必须使用多重检验校正后再判断是否显著”
... ...

   如果你也遇过这些疑问,欢迎参加我们的在线讲堂。相信1个小时后,你将会豁然开朗。
本期在线交流的内容包括:

(1) 统计的基本概念
   功能富集分析是什么逻辑?
   当没有先验分布的时候,怎么估算置信区间(permutation、bootstrap等相关的方法)
(2)多重检验的目的
(3)多重检验的方法有哪些?
    FDR、Q value、adjusted p value这些概念的由来和关系;
    P vlaue 和 Q value的区别;
    如何选取Q value的阈值标准;
    如何从p value估算Q value;

欢迎大家加入QQ群与嘉宾交流切磋~

交流地点:http://ke.qq.com/course/108998#term_id=100116154 交流QQ群 425346734
交流时间:2015年12月30日(周三)下午4-5点
交流嘉宾:周老师
备注:看视频前,建议先看看这篇文章:
显著检验与多重检验校正
http://www.omicshare.com/forum/thread-260-1-12.html
(出处: OmicShare Forum)




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 楼主| 发表于 2016.1.26 10:13:53 | 显示全部楼层

本次交流PPT在这里可以下载,赶紧拿去。




有疑问可在楼下跟帖提问噢~





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 楼主| 发表于 2016.1.26 10:14:09 | 显示全部楼层
事在人为~
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草履虫

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发表于 2016.3.16 17:56:25 | 显示全部楼层

谢谢 非常有帮助
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发表于 2016.5.20 16:08:13 | 显示全部楼层
非常专业的讲解,感谢分享
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发表于 2016.6.6 15:22:34 | 显示全部楼层
p.adjust返回的值怎么仍是p值?
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钵水母

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发表于 2016.6.7 13:34:47 | 显示全部楼层
谢谢分享
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发表于 2016.6.15 19:16:54 | 显示全部楼层
感谢
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钵水母

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发表于 2016.6.21 09:12:29 | 显示全部楼层
收藏了!!!
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发表于 2016.6.27 17:46:00 | 显示全部楼层
先了解一下
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中华鲟

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发表于 2016.7.26 19:44:43 | 显示全部楼层
很有帮助
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发表于 2016.9.13 10:36:32 | 显示全部楼层
花钱下载就回复下赚回来
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发表于 2016.9.15 22:13:14 | 显示全部楼层
谢谢,很实用的东西
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发表于 2016.9.20 14:24:11 | 显示全部楼层
谢谢分享
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发表于 2016.10.1 19:15:44 | 显示全部楼层
解决了困扰我多年的问题,太棒啦
然后呢,一起加油吧。
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草履虫

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发表于 2016.10.2 03:58:19 | 显示全部楼层
ppt还要奥币啊
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发表于 2016.10.2 09:59:44 | 显示全部楼层
再看一遍~·
然后呢,一起加油吧。
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草履虫

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学习了
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钵水母

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谢谢楼主了
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