查看: 7155|回复: 58

第11期在线交流“谈谈RNA-seq和GWAS中的pvalue和Qvalue”【视频】

  [复制链接]
  • TA的每日心情

    5 天前
  • 签到天数: 202 天

    连续签到: 2 天

    [LV.7]常住居民III

    管理员

    Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15

    主题
    121
    奥币
    7666
    积分
    2904
    注册时间
    2015.11.12
    在线时间
    648 小时

    推广达人宣传达人论坛元老


    发表于 2016.1.26 10:09:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
    第11期在线交流“谈谈RNA-seq和GWAS中的p value 和 Q value”


    二代测序数据是典型的大数据,统计是数据分析的基础。不同情况的P value估算是最常见的分析,例如:差异表达分析下的p value,gwas下的p value。由于检验次数的增加,多重检验校正又成为数据分析的必要步骤,于是Q value,adjusted p value,FDR等这些名词又冒了出来。有时候,大家都觉得晕啊!也许你可能遇到过这样的问题:




    “Q value 为什么大于 p value呢”
    “FDR 怎么大于1,是否分析出错了?”
    “我的kegg 富集分析,FDR < 5%找不到关注的pathway,是否可以放宽阈值呢?”
    “审稿人说,我的结果使用p value判断是不对的,必须使用多重检验校正后再判断是否显著”
    ... ...

       如果你也遇过这些疑问,欢迎参加我们的在线讲堂。相信1个小时后,你将会豁然开朗。
    本期在线交流的内容包括:

    (1) 统计的基本概念
       功能富集分析是什么逻辑?
       当没有先验分布的时候,怎么估算置信区间(permutation、bootstrap等相关的方法)
    (2)多重检验的目的
    (3)多重检验的方法有哪些?
        FDR、Q value、adjusted p value这些概念的由来和关系;
        P vlaue 和 Q value的区别;
        如何选取Q value的阈值标准;
        如何从p value估算Q value;

    欢迎大家加入QQ群与嘉宾交流切磋~

    交流地点:http://ke.qq.com/course/108998#term_id=100116154 交流QQ群 425346734
    交流时间:2015年12月30日(周三)下午4-5点
    交流嘉宾:周老师
    备注:看视频前,建议先看看这篇文章:
    显著检验与多重检验校正
    http://www.omicshare.com/forum/thread-260-1-12.html
    (出处: OmicShare Forum)




    本帖子中包含更多资源

    您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

    x
    事在人为~
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    5 天前
  • 签到天数: 202 天

    连续签到: 2 天

    [LV.7]常住居民III

    管理员

    Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15

    主题
    121
    奥币
    7666
    积分
    2904
    注册时间
    2015.11.12
    在线时间
    648 小时

    推广达人宣传达人论坛元老


     楼主| 发表于 2016.1.26 10:13:53 | 显示全部楼层

    本次交流PPT在这里可以下载,赶紧拿去。




    有疑问可在楼下跟帖提问噢~





    本帖子中包含更多资源

    您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

    x
    事在人为~
    回复 支持 3 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    5 天前
  • 签到天数: 202 天

    连续签到: 2 天

    [LV.7]常住居民III

    管理员

    Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15

    主题
    121
    奥币
    7666
    积分
    2904
    注册时间
    2015.11.12
    在线时间
    648 小时

    推广达人宣传达人论坛元老


     楼主| 发表于 2016.1.26 10:14:09 | 显示全部楼层
    事在人为~
    回复 支持 6 反对 2

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.3.16 17:44
  • 签到天数: 1 天

    连续签到: 1 天

    [LV.1]初来乍到

    草履虫

    Rank: 2

    主题
    0
    奥币
    378
    积分
    22
    注册时间
    2016.3.16
    在线时间
    2 小时

    发表于 2016.3.16 17:56:25 | 显示全部楼层

    谢谢 非常有帮助
    回复 支持 2 反对 0

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    no
    2018.7.27 20:27
  • 签到天数: 311 天

    连续签到: 1 天

    [LV.8]以坛为家I

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    0
    奥币
    1340
    积分
    429
    注册时间
    2016.3.31
    在线时间
    127 小时

    发表于 2016.5.20 16:08:13 | 显示全部楼层
    非常专业的讲解,感谢分享
    回复 支持 1 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    no
    2018.7.25 10:34
  • 签到天数: 103 天

    连续签到: 1 天

    [LV.6]常住居民II

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    1
    奥币
    1452
    积分
    138
    注册时间
    2016.5.20
    在线时间
    49 小时

    发表于 2016.6.6 15:22:34 | 显示全部楼层
    p.adjust返回的值怎么仍是p值?
    回复 支持 0 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2017.10.12 13:11
  • 签到天数: 53 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    549
    积分
    130
    注册时间
    2016.6.6
    在线时间
    26 小时

    发表于 2016.6.7 13:34:47 | 显示全部楼层
    谢谢分享
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2017.11.17 15:54
  • 签到天数: 32 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    2
    奥币
    507
    积分
    95
    注册时间
    2016.6.15
    在线时间
    13 小时

    发表于 2016.6.15 19:16:54 | 显示全部楼层
    感谢
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.7.11 11:36
  • 签到天数: 24 天

    连续签到: 4 天

    [LV.4]偶尔看看III

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    504
    积分
    109
    注册时间
    2016.6.4
    在线时间
    20 小时

    发表于 2016.6.21 09:12:29 | 显示全部楼层
    收藏了!!!
    回复

    使用道具 举报

    该用户从未签到

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    27
    奥币
    1275
    积分
    292
    注册时间
    2016.5.24
    在线时间
    144 小时

    发表于 2016.6.27 17:46:00 | 显示全部楼层
    先了解一下
    回复 支持 1 反对 0

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    yes!
    2018.8.8 08:52
  • 签到天数: 514 天

    连续签到: 3 天

    [LV.9]以坛为家II

    中华鲟

    Rank: 5Rank: 5

    主题
    7
    奥币
    2169
    积分
    882
    注册时间
    2016.4.8
    在线时间
    254 小时

    最佳新人


    发表于 2016.7.26 19:44:43 | 显示全部楼层
    很有帮助
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    yes!
    2018.4.11 20:06
  • 签到天数: 233 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    0
    奥币
    1040
    积分
    262
    注册时间
    2016.5.26
    在线时间
    82 小时

    发表于 2016.9.13 10:36:32 | 显示全部楼层
    花钱下载就回复下赚回来
    回复 支持 1 反对 0

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.9.27 11:42
  • 签到天数: 9 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    1
    奥币
    340
    积分
    54
    注册时间
    2016.9.10
    在线时间
    18 小时

    发表于 2016.9.15 22:13:14 | 显示全部楼层
    谢谢,很实用的东西
    回复 支持 0 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    吃饭
    2018.6.18 21:21
  • 签到天数: 116 天

    连续签到: 1 天

    [LV.6]常住居民II

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    1648
    积分
    106
    注册时间
    2016.8.10
    在线时间
    60 小时

    发表于 2016.9.20 14:24:11 | 显示全部楼层
    谢谢分享
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情
    吃饭
    昨天 08:00
  • 签到天数: 391 天

    连续签到: 9 天

    [LV.9]以坛为家II

    帝王蝶

    Rank: 4

    主题
    0
    奥币
    3071
    积分
    293
    注册时间
    2016.8.25
    在线时间
    79 小时

    发表于 2016.9.22 23:06:12 | 显示全部楼层
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.11.26 16:02
  • 签到天数: 48 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    6
    奥币
    735
    积分
    119
    注册时间
    2016.8.29
    在线时间
    28 小时

    发表于 2016.10.1 19:15:44 | 显示全部楼层
    解决了困扰我多年的问题,太棒啦
    然后呢,一起加油吧。
    回复 支持 1 反对 0

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.11.29 14:20
  • 签到天数: 11 天

    连续签到: 1 天

    [LV.3]偶尔看看II

    草履虫

    Rank: 2

    主题
    0
    奥币
    262
    积分
    26
    注册时间
    2016.9.30
    在线时间
    6 小时

    发表于 2016.10.2 03:58:19 | 显示全部楼层
    ppt还要奥币啊
    回复 支持 0 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.11.26 16:02
  • 签到天数: 48 天

    连续签到: 1 天

    [LV.5]常住居民I

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    6
    奥币
    735
    积分
    119
    注册时间
    2016.8.29
    在线时间
    28 小时

    发表于 2016.10.2 09:59:44 | 显示全部楼层
    再看一遍~·
    然后呢,一起加油吧。
    回复 支持 0 反对 1

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2016.10.11 09:17
  • 签到天数: 1 天

    连续签到: 1 天

    [LV.1]初来乍到

    草履虫

    Rank: 2

    主题
    0
    奥币
    259
    积分
    7
    注册时间
    2016.9.27
    在线时间
    5 小时

    发表于 2016.10.11 09:21:34 | 显示全部楼层
    学习了
    回复

    使用道具 举报

  • TA的每日心情

    2018.1.15 09:39
  • 签到天数: 158 天

    连续签到: 1 天

    [LV.7]常住居民III

    钵水母

    Rank: 3Rank: 3

    主题
    0
    奥币
    766
    积分
    143
    注册时间
    2016.9.28
    在线时间
    76 小时

    发表于 2016.10.11 10:30:03 | 显示全部楼层
    谢谢楼主了
    回复 支持 0 反对 1

    使用道具 举报

    您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

    本版积分规则

    快速回复 返回顶部 返回列表