留言板
- yiyuanmeioo
- 周老师，请教个问题，我做GSEA，按照你的教程，做人的是没有问题，但是做鼠的就会出现没有基因超过阈值的报错。不知是什么问题。
- 丁飞
- 周老师，您好！
我有一个疑问，目前公认的miRNA主要作用是抑制转录翻译或者降解mRNA，如果出现protein水平无变化，mRNA与miRNA有变化，要怎么解释，特别是出现miRNA和mRNA水平都有上调的现象！
- haha
- 周老师，您好, 请教一下做了大豆的RNA-seq分析，然后想做一下差异基因的mapman富集分析，该怎么弄？（ps：该如何选择合适的pathway和构建mapping？）
- Yangpanpan
- KEGG分类里包含很多与植物无关的pathway，怎么去除，只留与植物相关的。
- 怒火凤凰
- 周老师，你好！请教个问题：我手上有含油量、蛋白含量的表型，共5年的数据，有人研究发现单独的油和蛋白不稳定，容易受环境影响，但是油加蛋白的总量比较稳定，我们的数据也能得出这个结论。现在我们想在我们群体中验证在高总量的情况下更容易选择出稳定的高油的性状，于是用五年的油和五年的总量进行了一个相关性分析，老板的意思是要得到油和总量年份间的相关系数大于油年份间的相关系数才能证明那个结论，我的意思是用油和总量年份内的相关系数大于油年份间的相关系数就能证明。希望周老师留下宝贵的建议！感谢！
- lvl_2001
- 恩恩，好好，我好好学习一下！太感谢了！
基迪奥-周煌凯: 这个帖子有类似的脚本，只不过是 方差分析和t test的。
使用R语言，实现批量差异分析（t检验或方差分析）
http://www.omicshare.com/forum/thread-1002-1-12.htm ...
- lvl_2001
- 恩恩，好的，谢谢周老师了！感恩！永远是你的粉丝！
基迪奥-周煌凯: 这恐怕我没有时间。
- lvl_2001
- 恩恩，好的，谢谢周老师了！感恩！
基迪奥-周煌凯: 这恐怕我没有时间。
- lvl_2001
- 周老师您好，看到你给我的回复了，我查资料也是做卡方检验，但是我有一个文件，很多行，你能帮我写一个程序吗？多谢多谢，刚开始接触生物信息学，头脑太空白了，烦请您有时间帮我看看呢
基迪奥-周煌凯: 你可以试试卡方检验。
- lvl_2001
- 周老师您好，我想做allele分析，我现在知道allele之间的reads比例，比如是8:18, 7:17, 5:7 ,那这些个reads比用什么检验方法能看出是有差异的Aallele>Ballele?还是Aallele<Ballele?还是Aallele=Ballele？求赐教！！1
- htxing
- 周老师您好，在一个同学的推荐下，使用云平台热图工具，导入文件后，发现结果里什么都没有。是不是该软件有什么设置，导致运行不出结果。我的数据第一行是处理名称，第一列是基因名称。中间有些基因没有检测到表达的用NA 表示，请问是什么原因呢？
- chenSH
- 周老师知道吧，就是做维恩图的。你能给我发个链接吗？
基迪奥-周煌凯: 什么代码？哪个帖子？
- huangfeiyan
- 周老师你好，我是一位刚刚使用你们平台软件的新人，请问一下超过5M的表格文件怎么上传到云端呢？
- wang
- 周老师，你好，请教一个问题：
现在小麦的RNA-seq数据，可以用TGACv1那个版本来发表吗，还是用以前的iwgsc1.0+popseq那个版本比较好。（要与蛋白质数据一起分析）
- romantic昊
- 可以把第二届全国植物逆境生物学学术研讨会论文集（或目录）发我一份吗
- flyskyoo
- 周老师 您好！看了您“[R语言] 如何生成相关系数矩阵，并且绘制相关性热图”这个帖子非常受用 但是还有一些问题需要请教 用这个方法做出来后 很多显示"NA" 不知道是什么情况？我的数据放在给您回复帖子的附件中了29#楼
另外 我也准备计算下 P值，看了秀才 讲的帖子 但是在他的帖子中 没有具体的数据 所以不知道 他的数据的排列是怎么样的 自己尝试了一下 提示有错误 用的数据也是附件中的数据 所以请老师指点迷津 非常谢谢！
- luoxiaochen
- 看到楼下问周师傅有没有孩子，我笑趴在键盘上
- wudandan
- 麻烦问一下周老师在MEGA中如何计算蛋白质的进化速率快慢？
- 小圆圆的师傅
- 周师傅你好，你有孩子了吗
- joven1029
基迪奥-周煌凯: 好像没有具体资料，你先找一些基因组学方面的教科书资料看看。然后边用边学。
老师能具体说说书名吗？没有概念，比较迷惘 
谢谢老师
广州大学城智慧谷A5座5-6层
020-39341079
omicshare@genedenovo.com
