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蛋白数据库汇总【Protein Sequence&Protein Structure&Protein Domains 】

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钵水母

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发表于 2016.12.21 20:33:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 hld8124 于 2016.12.21 21:31 编辑

Protein Databases
Protein Sequence Databases - Protein Structure Databases - Protein Domains, Motifs and Signatures - Others
Protein Sequence Databases:
Antibodies: Sequence and Structure
BRENDA: Enzyme database
CD Antigens:  Database of CD antigens
dbCFC:  Cytokine family database
Histons:  Histone sequence database
HPRD:  Human protein reference database
InterPro: Intergrated documentation 5resources for protein families
iProClass: An integrated protein classification database
KIND:  A non-redundant protein sequence database
MHCPEP:  Database of MHC binding peptides
MIPS:  Munich information centre for protein sequences
PIR:  Annotated, and non-redundant protein sequence database
PIR-ALN: Curated database of protein sequence alignments
PIR-NREF: PIR nonredundent reference protein database
PMD:  Protein mutant database
PRF: Protein research foundation, Japan
ProClass: Non-redundant protein database
ProtoMap:  Hierarchical classification of swissprot proteins
REBASE:  Restriction enzyme database
RefSeq:   Reference sequence database at NCBI
SwissProt:  Curated protein sequence database
SPTR: Comprehensive protein sequence database
Transfac:  Transcription factor database
TrEMBL:  Annotated translations of EMBL nucleotide sequences
Tumor gene database:  Genes with cancer-causing mutations
[url=http://bmerc-www.bu.edu/wdrepeat/]WD repeats:[/url]  WD-repeat family of proteins
Protein Structure Databases:
Cath:  Protein structure classification
HIV Protease:  HIV protease database 3D structure
PDB:  3-D macromolecular structure data
PSI: Protein structure initiative
S2F: Structure to function project
Scop:  Structural Classification of Proteins

Protein Domains, Motifs & Signatures:
BLOCKS:  Multipe aligned segments of conserved protein regions
CCD:  Conserved domain database and search service
DOMO:  Homologous protein domain families
Pfam:  Database of protein domains and HMMs
ProDom:  Protein domain database
Prints:  Protein motif fingerprint database
Prosite:   Database of protein families and domains
SMART:  Simple modular architecture research tool
TIGRFAM: Protein families based on HMMs

Others:
Phospho Site:  Database of phosphorylation sites

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参与人数 3奥币 +50 贡献 +20 收起 理由
小瑶 + 20 膜拜!
基迪奥小师妹 + 10 + 10 太给力了!还有链接!
hld8124 + 20 + 10 Good job! 比较好的汇总,多谢分享,值得收.

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中华鲟

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Cool
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发表于 2016.12.26 11:23:36 | 显示全部楼层
好东西!马克!
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谢谢楼主
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中华鲟

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真全啊!
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总结的全面
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钵水母

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谢谢楼主 太给力了
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帝王蝶

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