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代谢组是指参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长发育功能的小分子化合物集合，代谢物与表型最为接近，反应了生物体的真实生理状态。代谢组学是对生物样本的代谢物进行定性和定量分析，以发现新的代谢物、新的代谢通路，或寻找代谢物与生理病理变化相关关系的一门科学。
代谢组是指机体内参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长发育功能的相对分子量小于1000的内源性小分子化合物的集合。与基因组相比，代谢组与表型最为接近，更能直接反映机体对环境的应答，同时环境对代谢组的影响也是最大的，环境对生物体的影响也是最终体现为代谢物的变化。
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